出版物

論文

プレプリント

• Oki T*, Hatakeyama TS, Nishikawa S, Ishihara S, Namba T*
  "Anti-aligning Self-propelled Model of Two Species: Emergence of Self-organized Heterogeneous Aligned and Clustered Order"
  arXiv:2502.16821
• Hatakeyama TS*
  "Enzymatic Mpemba Effect: Slowing of biochemical reactions by increasing enzyme concentration"
  arXiv:2411.08058
• Yamagishi JF*, Hatakeyama TS*
  "Global Constraint Principle for Microbial Growth Law"
  arXiv:2409.12482

査読済み

• Hatakeyama TS*, Ohbayashi R
  “Evolutionary Innovation by Polyploidy”
  PRX Life. 2(4), 043021, 2024
  APSのPhysicsでHighlighに選ばれました
  arXiv、日本語プレスリリース、英語プレスリリース
• Kajita MK, Konishi Y, Hatakeyama TS*.
  “Active thermodynamic force driven mitochondrial alignment”
  Physical Review Research. 6(2), L022024, 2024
  arXiv、プレスリリース
• Yamagishi JF, Hatakeyama TS*.
  “Linear Response Theory of Evolved Metabolic Systems”
  Physical Review Letters. 131 (2), 028401, 2023
  arXiv、日本語プレスリリース、英語プレスリリース
• Hatakeyama TS*, Kaneko K.
  “A Linear Reciprocal Relationship Between Robustness and Plasticity in Homeostatic Biological Networks”
  PLoS one. 18(1), e0277181, 2023
• Oda AH*, Tamura M, Kaneko K, Ohta K, Hatakeyama TS*.
  “Autotoxin-mediated latecomer killing in yeast communities”
  PLoS Biology. 20 (11), e3001844, 2022
  日本語プレスリリース、英語プレスリリース
• Matsushita Y, Hatakeyama TS, Kaneko K*.
  “Dynamical systems theory of cellular reprogramming”
  Physical Review Research. 4 (2), L022008, 2022
• Yamagishi JF, Hatakeyama TS*.
  “Microeconomics of metabolism: The Warburg effect as Giffen behavior”
  Bulletin of Mathematical Biology. 83 (12), 1—17, 2021
  日本語プレスリリース
• Tang QY*, Hatakeyama TS, Kaneko K*.
  “Functional sensitivity and mutational robustness of proteins”
  Physical Review Research. 2 (3), 033452, 2020
• Hatakeyama TS*, Kaneko K.
  “Transition in relaxation paths in allosteric molecules: Enzymatic kinetically constrained model”
  Physical Review Research Rapid Communication. 2 (1), 012005, 2020
  日本語プレスリリース
• Ohbayashi R*, Nakamachi A, Hatakeyama TS, Watanabe S, Kanesaki Y, Chibazakura T, Yoshikawa H, Miyagishima S-y*.
  “Coordination of Polyploid Chromosome Replication with Cell Size and Growth in a Cyanobacterium”
  mBio. 10(2), e00510-19, 2019
• Hatakeyama TS*, Chikara F.
  “Metabolic dynamics restricted by conserved carriers: Jamming and feedback”
  PLoS Computational Biology. 13(11), e1005847, 2017
• Hatakeyama TS*, Kaneko K.
  “Robustness of spatial patterns in buffered reaction-diffusion systems and its reciprocity with phase plasticity”
  Physical Review E Rapid Communication. 95(3), 030201, 2017
• Young JT, Hatakeyama TS (co-first author), Kaneko K*.
  “Dynamics robustness of cascading systems”
  PLoS Computational Biology. 13(3), e1005434, 2017
• Hatakeyama TS*, Kaneko K.
  “Reciprocity Between Robustness of Period and Plasticity of Phase in Biological Clocks”
  Physical Review Letters. 115, 218101, 2015
  APSのPhysicsでHighlighに選ばれました
  日本語プレスリリース
• Hatakeyama TS*, Kaneko K.
  “Homeostasis of the period of post-translational biochemical oscillators”
  FEBS Letters. 588, 2282–2287, 2014
• Hatakeyama TS*, Kaneko K*.
  “Kinetic memory based on enzyme-limited competition”
  PLoS Computational Biology. 10(8), e1003784, 2014
• Hatakeyama TS, Kaneko K*.
  “Generic temperature compensation of biological clocks by autonomous regulation of catalyst concentration”
  Proceedings of National Academy of Science USA. 109,8109-14, 2012
  日本語プレスリリース、英語プレスリリース、東京大学による紹介記事
• Hosokawa N, Hatakeyama TS, Kojima T, Kikuchi Y, Ito H, Iwasaki H*.
  “Circadian transcriptional regulation by the posttranslational oscillator without de novo clock gene expression in Synechococcus”
  Proceedings of National Academy of Science USA. 108, 15396-401, 2011

日本語で書いたもの

本

• 『システム生物学入門』講談社サイエンティフィク（2023）
  姫岡優介さんと共同執筆
  畠山は「はじめに」、第1章、第I部（第2、3章）、第II部（第4-8章）を執筆
  amazon、出版社web site
  正誤表

研究の解説

• 畠山 哲央、金子 邦彦『生体リズムの頑健性と可塑性』生物物理（2017）
• 畠山 哲央『変わることと変わらないことを巡って』東京大学教養学部報（2016）
• 畠山 哲央、小田 有沙『利己的な酵母たち ―新参者殺しの発見―』東京大学教養学部報（2023）
• 畠山 哲央、小田 有沙『酵母の集団における“latecomer killing”現象の発見』生物物理（2023）

その他

• 畠山 哲央『ウミウシのはなし』東京大学教養学部報（2014）
  東京大学大学院総合文化の助教に着任したときに書いた文章です。
• 『生命システムの数理 – 現象の背後にある普遍性を目指して』（2020）
  数理生物学会で発表した内容を、切江志龍さんと堀部和也さんにまとめていただきました。
• 『in cephalo biologyの散歩道』現代化学（2025 -）
  エッセイの連載です。
  2025年1月号：街の景色，研究の景色
  2025年2月号：パン食う彼ら，米食う我ら
  2025年3月号：宝石の国